------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 3017 1jqb_A) ( 42 1a4i_A) 0.4666 0.6996 4.9851 ( 0 12 21) 0 0.5999 0.8992 15 10 ( 3017 1jqb_A) ( 265 1b16_A) 0.5333 0.5000 3.2025 ( 0 10 28) 0 0.7333 0.6875 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 312 1b7g_O) 0.3999 0.4613 7.1508 ( 0 6 15) 0 0.6645 0.7649 15 13 ( 3017 1jqb_A) ( 319 1b8p_A) 0.6665 0.9085 4.0330 ( 0 20 45) 0 0.7305 0.9869 15 11 ( 3017 1jqb_A) ( 352 1bdb ) 0.5333 0.4444 2.7673 ( 0 10 28) 0 0.7988 0.6662 15 18 ( 3017 1jqb_A) ( 377 1bg6 ) 0.6000 0.5000 3.2686 ( 0 17 36) 0 0.6880 0.5914 15 18 ( 3017 1jqb_A) ( 506 1c1d_A) 0.5098 0.6041 4.4841 ( 1 8 28) 0 0.5332 0.6662 15 12 ( 3017 1jqb_A) ( 707 1cyd_A) 0.5333 0.4444 3.2023 ( 0 8 28) 0 0.7332 0.6110 15 18 ( 3017 1jqb_A) ( 781 1db3_A) 0.4667 0.3182 3.0081 ( 0 9 21) 0 0.7332 0.5000 15 22 ( 3017 1jqb_A) ( 847 1dih ) 0.4666 0.9974 5.1120 ( 0 2 21) 0 0.4667 0.9999 15 7 ( 3017 1jqb_A) ( 873 1dlj_A) 0.6000 0.5625 2.9271 ( 0 19 36) 0 0.7230 0.6800 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 906 1dpg_A) 0.4665 0.5382 6.1365 ( 0 5 21) 0 0.7331 0.8458 15 13 ( 3017 1jqb_A) ( 972 1dxy ) 0.4667 0.4375 2.9914 ( 0 7 21) 0 0.6665 0.6249 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 1053 1e6u_A) 0.3333 0.2273 4.4771 ( 0 2 10) 0 0.7310 0.4996 15 22 ( 3017 1jqb_A) ( 1071 1e7w_A) 0.4666 0.4117 4.3009 ( 0 4 21) 0 0.7332 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 1094 1ebf_A) 0.3333 0.4167 3.8599 ( 0 4 10) 0 0.5995 0.7486 15 12 ( 3017 1jqb_A) ( 1117 1edz_A) 0.4667 0.5833 3.2304 ( 0 9 21) 0 0.5732 0.6790 15 12 ( 3017 1jqb_A) ( 1189 1ek6_A) 0.5333 0.3636 3.0864 ( 0 12 28) 0 0.7331 0.5252 15 22 ( 3017 1jqb_A) ( 1219 1enp ) 0.4666 0.3889 5.0897 ( 0 7 21) 0 0.7987 0.6661 15 18 ( 3017 1jqb_A) ( 1221 1eny ) 0.5333 0.4706 3.1526 ( 0 13 28) 0 0.7332 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 1242 1eq2_A) 0.4667 0.3182 2.8409 ( 0 10 21) 0 0.7320 0.4998 15 22 ( 3017 1jqb_A) ( 1355 1f14_A) 0.6654 0.6654 3.5471 ( 1 23 45) 0 0.6654 0.6654 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 1436 1f8f_A) 0.9331 0.9996 2.3488 ( 1 55 91) 0 0.9331 0.9996 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 1487 1ff9_A) 0.5333 0.5333 2.5030 ( 0 12 28) 0 0.7994 0.7994 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 1531 1fjh_A) 0.4000 0.3750 3.7895 ( 0 1 15) 0 0.7329 0.6872 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 1560 1fmc_A) 0.5333 0.4706 3.2261 ( 0 9 28) 0 0.7986 0.7052 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 1804 1gdh_A) 0.4667 0.5000 2.4016 ( 0 10 21) 0 0.7331 0.7854 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 1807 1gee_A) 0.5333 0.4000 3.1022 ( 0 11 28) 0 0.7332 0.5500 15 20 ( 3017 1jqb_A) ( 1809 1geg_A) 0.5333 0.4706 3.1341 ( 0 10 28) 0 0.7985 0.7051 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 1899 1gpj_A) 0.6489 0.7838 4.2344 ( 2 23 45) 0 0.6666 0.8330 15 12 ( 3017 1jqb_A) ( 1922 1gr0_A) 0.3543 0.3688 6.4589 ( 2 9 15) 0 0.6640 0.7106 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 1948 1gtm_A) 0.4667 0.4375 3.4169 ( 0 10 21) 0 0.6662 0.6246 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 1956 1gu7_A) 0.9903 0.8771 3.3429 ( 3 68 105) 0 0.9903 0.8771 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2004 1gy8_A) 0.4000 0.2609 4.1520 ( 0 6 15) 0 0.7332 0.4782 15 23 ( 3017 1jqb_A) ( 2016 1gz3_A) 0.6664 0.5881 4.8069 ( 0 23 45) 0 0.7324 0.6465 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2017 1gz6_A) 0.4667 0.3500 3.1170 ( 0 7 21) 0 0.7996 0.5999 15 20 ( 3017 1jqb_A) ( 2046 1h2b_A) 0.9201 0.9816 2.3384 ( 3 57 91) 0 0.9201 0.9816 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 2090 1h5q_A) 0.5333 0.4000 3.1155 ( 0 10 28) 0 0.7332 0.5500 15 20 ( 3017 1jqb_A) ( 2095 1h6d_A) 0.4000 0.4285 5.6127 ( 0 5 15) 0 0.6666 0.7142 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 2180 1hdc_A) 0.5333 0.4706 2.9070 ( 0 11 28) 0 0.7333 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2189 1hdo_A) 0.6000 0.6000 2.4530 ( 0 16 36) 0 0.7329 0.7329 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 2194 1het_A) 0.9998 0.9998 2.2476 ( 1 66 105) 0 0.9998 0.9998 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 2270 1hrd_A) 0.4021 0.3983 4.6291 ( 6 25 45) 0 0.7299 0.6850 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 2309 1hwx_A) 0.3333 0.2941 4.9942 ( 0 5 10) 0 0.7192 0.6394 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2316 1hxh_A) 0.5333 0.5000 3.2793 ( 0 9 28) 0 0.7333 0.6874 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 2328 1hye_A) 0.6652 0.9021 3.7959 ( 1 22 45) 0 0.6659 0.9056 15 11 ( 3017 1jqb_A) ( 2330 1hyh_A) 0.6458 0.8259 3.6140 ( 2 22 45) 0 0.6458 0.8259 15 11 ( 3017 1jqb_A) ( 2368 1i24_A) 0.5333 0.2963 3.0594 ( 0 12 28) 0 0.7992 0.4555 15 27 ( 3017 1jqb_A) ( 2376 1i36_A) 0.5255 0.5255 8.2369 ( 1 11 28) 0 0.5999 0.5999 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 2463 1id1_A) 0.6666 0.7692 2.5326 ( 0 21 45) 0 0.6666 0.7692 15 13 ( 3017 1jqb_A) ( 2615 1iuk_A) 0.5332 0.6664 4.9869 ( 0 9 28) 0 0.6663 0.8322 15 12 ( 3017 1jqb_A) ( 2657 1iy8_A) 0.5333 0.4706 3.1617 ( 0 8 28) 0 0.7332 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2674 1iz0_A) 0.8666 0.8666 2.4188 ( 0 51 78) 0 0.8666 0.8666 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 2725 1j3v_A) 0.5333 0.5714 2.5247 ( 0 11 28) 0 0.6655 0.7127 15 14 ( 3017 1jqb_A) ( 2736 1j5p_A) 0.4000 0.6000 3.4871 ( 0 7 15) 0 0.6000 0.8998 15 10 ( 3017 1jqb_A) ( 2781 1ja9_A) 0.4667 0.4118 3.1457 ( 0 5 21) 0 0.7333 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 2789 1jax_A) 0.3333 0.2500 7.1474 ( 0 3 10) 0 0.5998 0.4932 15 20 ( 3017 1jqb_A) ( 3017 1jqb_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 77 105) 0 1.0000 1.0000 15 15 ( 3017 1jqb_A) ( 3059 1jtv_A) 0.5333 0.4444 3.9091 ( 0 13 28) 0 0.7332 0.6110 15 18 ( 3017 1jqb_A) ( 3072 1jvb_A) 0.8639 0.9944 2.5716 ( 2 52 78) 0 0.8639 0.9944 15 13 ( 3017 1jqb_A) ( 3144 1k2w_A) 0.5333 0.4706 3.2639 ( 0 11 28) 0 0.7332 0.6470 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 3192 1k6j_A) 0.5333 0.3333 2.9186 ( 0 12 28) 0 0.7331 0.4583 15 24 ( 3017 1jqb_A) ( 3257 1kbz_A) 0.4664 0.3684 7.2246 ( 0 8 21) 0 0.7331 0.5789 15 19 ( 3017 1jqb_A) ( 3385 1kol_A) 0.9217 0.8665 2.6681 ( 3 59 91) 0 0.9217 0.8665 15 16 ( 3017 1jqb_A) ( 3414 1ks9_A) 0.4667 0.4118 2.7265 ( 0 8 21) 0 0.6762 0.6141 15 17 ( 3017 1jqb_A) ( 3481 1kyq_A) 0.4000 0.6000 2.4014 ( 0 3 15) 0 0.5997 0.8975 15 10 ( 3017 1jqb_A) 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