------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 2330 1hyh_A) ( 42 1a4i_A) 0.5849 0.6237 3.4742 ( 1 8 21) 0 0.5849 0.6237 11 10 ( 2330 1hyh_A) ( 265 1b16_A) 0.9927 0.6864 4.7794 ( 1 26 55) 0 0.9927 0.6864 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 312 1b7g_O) 0.9042 0.7671 5.6312 ( 1 28 45) 0 0.9042 0.7671 11 13 ( 2330 1hyh_A) ( 319 1b8p_A) 0.9978 0.9978 2.3272 ( 1 33 55) 0 0.9978 0.9978 11 11 ( 2330 1hyh_A) ( 352 1bdb ) 0.9940 0.6106 4.3842 ( 1 27 55) 0 0.9985 0.6110 11 18 ( 2330 1hyh_A) ( 377 1bg6 ) 0.9997 0.6111 3.0670 ( 0 40 55) 0 0.9997 0.6111 11 18 ( 2330 1hyh_A) ( 506 1c1d_A) 0.6359 0.5830 5.9460 ( 0 8 21) 0 0.6827 0.6365 11 12 ( 2330 1hyh_A) ( 707 1cyd_A) 0.9966 0.6108 5.4687 ( 0 22 55) 0 0.9966 0.6108 11 18 ( 2330 1hyh_A) ( 781 1db3_A) 0.8456 0.4522 4.9544 ( 2 24 45) 0 0.8982 0.4542 11 22 ( 2330 1hyh_A) ( 847 1dih ) 0.5850 0.7341 3.1894 ( 1 8 21) 0 0.6362 0.9989 11 7 ( 2330 1hyh_A) ( 873 1dlj_A) 0.9997 0.6875 2.9952 ( 0 41 55) 0 0.9997 0.6875 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 906 1dpg_A) 0.9085 0.7690 3.9813 ( 0 26 45) 0 0.9085 0.7845 11 13 ( 2330 1hyh_A) ( 972 1dxy ) 0.7269 0.4999 4.6127 ( 0 15 28) 0 0.8115 0.6090 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 1053 1e6u_A) 0.7103 0.3631 3.7231 ( 1 13 28) 0 0.8042 0.4086 11 22 ( 2330 1hyh_A) ( 1071 1e7w_A) 0.9884 0.6457 5.2851 ( 1 23 55) 0 0.9884 0.6457 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 1094 1ebf_A) 0.5454 0.4999 4.5547 ( 0 6 15) 0 0.5454 0.4999 11 12 ( 2330 1hyh_A) ( 1117 1edz_A) 0.6385 0.6042 2.7003 ( 2 16 28) 0 0.6385 0.6042 11 12 ( 2330 1hyh_A) ( 1189 1ek6_A) 0.9943 0.4998 4.5852 ( 1 28 55) 0 0.9943 0.4998 11 22 ( 2330 1hyh_A) ( 1219 1enp ) 0.9483 0.6062 5.1051 ( 2 29 55) 0 0.9483 0.6062 11 18 ( 2330 1hyh_A) ( 1221 1eny ) 0.9069 0.5880 5.5118 ( 0 23 45) 0 0.9075 0.6241 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 1242 1eq2_A) 0.8534 0.4525 5.2375 ( 2 25 45) 0 0.8606 0.4825 11 22 ( 2330 1hyh_A) ( 1355 1f14_A) 0.9831 0.7296 3.1965 ( 2 39 55) 0 0.9831 0.7296 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 1436 1f8f_A) 0.8993 0.7113 3.4956 ( 1 20 45) 0 0.8993 0.7113 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 1487 1ff9_A) 0.9494 0.7216 4.1902 ( 2 29 55) 0 0.9946 0.7322 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 1531 1fjh_A) 0.8168 0.5623 5.6282 ( 0 10 36) 0 0.9051 0.6244 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 1560 1fmc_A) 0.9895 0.6458 5.3982 ( 1 24 55) 0 0.9895 0.6458 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 1804 1gdh_A) 0.7271 0.5714 3.6254 ( 0 16 28) 0 0.9044 0.7302 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 1807 1gee_A) 0.9919 0.5496 5.2145 ( 1 26 55) 0 0.9973 0.5499 11 20 ( 2330 1hyh_A) ( 1809 1geg_A) 0.9345 0.6385 5.0922 ( 2 27 55) 0 0.9345 0.6385 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 1899 1gpj_A) 0.9077 0.8324 4.9133 ( 0 28 45) 0 0.9077 0.8324 11 12 ( 2330 1hyh_A) ( 1922 1gr0_A) 0.8094 0.6402 3.7678 ( 1 18 36) 0 0.8976 0.7108 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 1948 1gtm_A) 0.6243 0.4356 3.6841 ( 1 12 21) 0 0.7256 0.5155 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 1956 1gu7_A) 0.8541 0.5811 4.3925 ( 2 25 45) 0 0.8541 0.5811 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2004 1gy8_A) 0.9540 0.4770 4.9952 ( 2 30 55) 0 0.9540 0.4770 11 23 ( 2330 1hyh_A) ( 2016 1gz3_A) 0.8170 0.5293 5.3885 ( 0 14 36) 0 0.8170 0.5584 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2017 1gz6_A) 0.9079 0.4999 4.7374 ( 0 17 45) 0 0.9079 0.5363 11 20 ( 2330 1hyh_A) ( 2046 1h2b_A) 0.9023 0.7122 3.3679 ( 1 22 45) 0 0.9052 0.7131 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 2090 1h5q_A) 0.9917 0.5496 5.2818 ( 1 26 55) 0 0.9917 0.5496 11 20 ( 2330 1hyh_A) ( 2095 1h6d_A) 0.8462 0.6933 3.9817 ( 2 24 45) 0 0.8462 0.6933 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 2180 1hdc_A) 0.9901 0.6459 5.0912 ( 1 24 55) 0 0.9901 0.6459 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2189 1hdo_A) 0.9018 0.6651 4.3123 ( 1 22 45) 0 0.9018 0.6651 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 2194 1het_A) 0.8993 0.6646 3.4308 ( 1 20 45) 0 0.8993 0.6646 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 2270 1hrd_A) 0.5454 0.3750 3.9081 ( 0 8 15) 0 0.8169 0.5623 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 2309 1hwx_A) 0.6836 0.4650 4.3704 ( 1 10 28) 0 0.6836 0.4650 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2316 1hxh_A) 0.9162 0.6723 5.0449 ( 2 25 55) 0 0.9162 0.6723 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 2328 1hye_A) 0.9990 0.9990 1.4055 ( 1 40 55) 0 0.9990 0.9990 11 11 ( 2330 1hyh_A) ( 2330 1hyh_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 41 55) 0 1.0000 1.0000 11 11 ( 2330 1hyh_A) ( 2368 1i24_A) 0.9957 0.4074 3.8154 ( 1 29 55) 0 0.9957 0.4074 11 27 ( 2330 1hyh_A) ( 2376 1i36_A) 0.9088 0.6666 3.2160 ( 0 29 45) 0 0.9088 0.6666 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 2463 1id1_A) 0.9644 0.8300 3.8603 ( 2 32 55) 0 0.9644 0.8300 11 13 ( 2330 1hyh_A) ( 2615 1iuk_A) 0.8104 0.7449 5.1541 ( 1 19 36) 0 0.8452 0.7898 11 12 ( 2330 1hyh_A) ( 2657 1iy8_A) 0.9970 0.6467 5.2864 ( 0 24 55) 0 0.9970 0.6467 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2674 1iz0_A) 0.8462 0.6516 3.9520 ( 2 24 45) 0 0.9056 0.6659 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 2725 1j3v_A) 0.9089 0.7142 2.8276 ( 0 28 45) 0 0.9089 0.7142 11 14 ( 2330 1hyh_A) ( 2736 1j5p_A) 0.7272 0.7998 3.3853 ( 0 14 28) 0 0.8070 0.8823 11 10 ( 2330 1hyh_A) ( 2781 1ja9_A) 0.9914 0.6461 5.0215 ( 1 25 55) 0 0.9914 0.6461 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 2789 1jax_A) 0.9773 0.5488 2.6902 ( 2 36 55) 0 0.9982 0.5499 11 20 ( 2330 1hyh_A) ( 3017 1jqb_A) 0.8259 0.6458 3.6140 ( 2 22 45) 0 0.8259 0.6458 11 15 ( 2330 1hyh_A) ( 3059 1jtv_A) 0.9408 0.6054 5.7037 ( 2 28 55) 0 0.9408 0.6054 11 18 ( 2330 1hyh_A) ( 3072 1jvb_A) 0.8112 0.6893 2.7177 ( 1 19 36) 0 0.8131 0.6901 11 13 ( 2330 1hyh_A) ( 3144 1k2w_A) 0.9927 0.6462 5.1809 ( 1 27 55) 0 0.9927 0.6462 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 3192 1k6j_A) 0.9934 0.4582 4.2219 ( 1 26 55) 0 0.9934 0.4582 11 24 ( 2330 1hyh_A) ( 3257 1kbz_A) 0.5454 0.3158 4.0757 ( 0 3 15) 0 0.9066 0.5392 11 19 ( 2330 1hyh_A) ( 3385 1kol_A) 0.8180 0.5625 3.2304 ( 0 20 36) 0 0.9052 0.6244 11 16 ( 2330 1hyh_A) ( 3414 1ks9_A) 0.9066 0.5880 4.3183 ( 1 31 45) 0 0.9066 0.5880 11 17 ( 2330 1hyh_A) ( 3481 1kyq_A) 0.6836 0.7340 4.0168 ( 1 10 28) 0 0.6836 0.7340 11 10 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