------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 6191 1v7o_A) ( 25 1a28_A) 0.3819 0.2821 11.1359 ( 1 6 6) 0 0.3999 0.2857 10 14 ( 6191 1v7o_A) ( 41 1a4i_A) 0.1970 0.1993 5.5674 ( 2 4 6) 0 0.4000 0.5714 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 51 1a6c_A) 0.4000 0.3636 5.2771 ( 0 3 6) 0 0.4000 0.3636 10 11 ( 6191 1v7o_A) ( 62 1a79_A) 0.3362 0.3787 10.3145 ( 1 4 6) 0 0.4999 0.7135 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 64 1a7s ) 0.3999 0.3077 6.8155 ( 0 5 6) 0 0.6997 0.5384 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 77 1a8r_A) 0.3999 0.3077 6.7355 ( 0 2 6) 0 0.4996 0.3845 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 91 1aa6 ) 0.3988 0.1143 13.1661 ( 0 4 6) 0 0.3988 0.1559 10 35 ( 6191 1v7o_A) ( 96 1aba ) 0.3991 0.5662 12.3399 ( 0 5 6) 0 0.3991 0.5662 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 129 1ahs_A) 0.3998 0.4441 8.3975 ( 0 4 6) 0 0.5000 0.5555 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 136 1aiu ) 0.3999 0.4997 6.8937 ( 0 3 6) 0 0.5998 0.7494 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 147 1all_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 150 1aln ) 0.3999 0.4996 7.5363 ( 0 4 6) 0 0.3999 0.4996 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 153 1aly ) 0.3998 0.4440 8.7979 ( 0 2 6) 0 0.4000 0.4444 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 155 1am7_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 157 1amf ) 0.3996 0.2000 9.7765 ( 0 3 6) 0 0.4530 0.2481 10 20 ( 6191 1v7o_A) ( 161 1an8 ) 0.1970 0.1980 10.6187 ( 2 4 6) 0 0.5982 0.6636 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 162 1an8 ) nil ( 6191 1v7o_A) ( 169 1aoh_A) 0.3999 0.3636 6.8712 ( 0 4 6) 0 0.4000 0.3636 10 11 ( 6191 1v7o_A) ( 177 1aoz_A) 0.3998 0.4442 7.8799 ( 0 4 6) 0 0.4000 0.4444 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 191 1aqz_A) 0.3999 0.4997 7.2464 ( 0 5 6) 0 0.3999 0.4997 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 198 1at0 ) 0.4990 0.3332 9.6656 ( 0 7 10) 0 0.4990 0.3332 10 15 ( 6191 1v7o_A) ( 207 1aua ) 0.4000 0.3077 5.8486 ( 0 3 6) 0 0.4000 0.3296 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 233 1axi_B) 0.3996 0.6620 9.8589 ( 0 4 6) 0 0.3996 0.6620 10 6 ( 6191 1v7o_A) ( 259 1b0b ) nil ( 6191 1v7o_A) ( 293 1b5l ) nil ( 6191 1v7o_A) ( 300 1b6a ) 0.3999 0.2500 7.2303 ( 0 4 6) 0 0.5995 0.3750 10 16 ( 6191 1v7o_A) ( 305 1b6r_A) 0.5732 0.3722 6.0612 ( 1 9 15) 0 0.5732 0.3722 10 16 ( 6191 1v7o_A) ( 307 1b74_A) 0.3996 0.4987 10.1488 ( 0 3 6) 0 0.4997 0.6240 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 315 1b8a_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 317 1b8d_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 329 1b9o_A) 0.3361 0.3786 10.9406 ( 1 4 6) 1 0.3361 0.3786 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 340 1bb9 ) nil ( 6191 1v7o_A) ( 350 1bd7_A) 0.4000 0.2353 5.7775 ( 0 4 6) 0 0.4999 0.3657 10 17 ( 6191 1v7o_A) ( 351 1bd8 ) nil ( 6191 1v7o_A) ( 360 1beb_A) 0.4994 0.4542 8.3689 ( 0 6 10) 0 0.6995 0.6360 10 11 ( 6191 1v7o_A) ( 361 1bed ) 0.3999 0.3333 7.0490 ( 0 5 6) 0 0.3999 0.3333 10 12 ( 6191 1v7o_A) ( 365 1bf2 ) 0.3999 0.5706 7.7148 ( 0 4 6) 0 0.4000 0.5714 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 367 1bf2 ) 0.4981 0.4981 11.2143 ( 0 6 10) 0 0.4998 0.4998 10 10 ( 6191 1v7o_A) ( 372 1bfg ) 0.4000 0.4000 5.6926 ( 0 4 6) 0 0.4996 0.4996 10 10 ( 6191 1v7o_A) ( 387 1bhg_A) 0.3998 0.4441 8.3996 ( 0 3 6) 0 0.3998 0.4441 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 405 1bih_A) 0.3994 0.4434 11.2799 ( 0 1 6) 0 0.3994 0.4434 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 417 1bkf ) 0.3998 0.5702 8.5285 ( 0 3 6) 0 0.3998 0.5702 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 420 1bkz_A) 0.4000 0.4000 5.0427 ( 0 2 6) 0 0.5998 0.5998 10 10 ( 6191 1v7o_A) ( 433 1bo4_A) 0.3995 0.3995 10.8874 ( 0 4 6) 0 0.5994 0.5994 10 10 ( 6191 1v7o_A) ( 442 1bou_B) 0.4000 0.2000 5.9353 ( 0 4 6) 0 0.5039 0.2954 10 20 ( 6191 1v7o_A) ( 460 1btn ) 0.4000 0.4999 5.6054 ( 0 4 6) 0 0.4000 0.4999 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 472 1bup_A) 0.3993 0.3331 11.5314 ( 0 5 6) 0 0.3997 0.3332 10 12 ( 6191 1v7o_A) ( 491 1byf_A) 0.3995 0.5684 10.7051 ( 0 3 6) 0 0.3995 0.5684 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 495 1byr_A) 0.3999 0.3333 7.4001 ( 0 3 6) 0 0.5994 0.4998 10 12 ( 6191 1v7o_A) ( 541 1c8b_A) 0.4996 0.2778 7.5459 ( 0 6 10) 0 0.5044 0.3258 10 18 ( 6191 1v7o_A) ( 543 1c8n_A) 0.3996 0.2856 10.3199 ( 0 3 6) 0 0.4000 0.2857 10 14 ( 6191 1v7o_A) ( 553 1cb8_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 561 1cc8_A) 0.4000 0.6667 2.3192 ( 0 2 6) 1 0.4000 0.6667 10 6 ( 6191 1v7o_A) ( 584 1cg2_A) 0.3999 0.2105 6.0464 ( 0 1 6) 0 0.4531 0.2608 10 19 ( 6191 1v7o_A) ( 587 1cgh_A) 0.3999 0.2667 6.2615 ( 0 4 6) 0 0.6997 0.4666 10 15 ( 6191 1v7o_A) ( 609 1cjc_A) 0.3998 0.2857 8.5244 ( 0 3 6) 1 0.3998 0.2857 10 14 ( 6191 1v7o_A) ( 619 1ckm_A) 0.3998 0.2222 8.2622 ( 0 5 6) 0 0.4995 0.2778 10 18 ( 6191 1v7o_A) ( 624 1cl1_A) 0.4810 0.1850 11.2501 ( 1 8 10) 0 0.5998 0.2860 10 27 ( 6191 1v7o_A) ( 635 1cmx_A) 0.3998 0.3076 8.4934 ( 0 4 6) 0 0.5996 0.4614 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 672 1cs8_A) 0.4000 0.2000 5.7912 ( 0 4 6) 0 0.4000 0.2693 10 20 ( 6191 1v7o_A) ( 678 1ct9_A) 0.3363 0.1799 8.3961 ( 1 4 6) 0 0.3994 0.1929 10 22 ( 6191 1v7o_A) ( 683 1cuk ) 0.3999 0.6652 7.3427 ( 0 4 6) 0 0.3999 0.6652 10 6 ( 6191 1v7o_A) ( 719 1d0n_A) 0.3999 0.5710 6.4463 ( 0 4 6) 0 0.3999 0.5710 10 7 ( 6191 1v7o_A) ( 729 1d2f_A) 0.3999 0.1905 7.1085 ( 0 3 6) 0 0.3999 0.3021 10 21 ( 6191 1v7o_A) ( 735 1d2p_A) 0.3994 0.4981 11.3084 ( 0 2 6) 0 0.3994 0.4981 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 740 1d3b_A) 0.1970 0.1987 9.3484 ( 2 4 6) 0 0.1970 0.1987 10 8 ( 6191 1v7o_A) ( 765 1d7p_M) 0.3998 0.3076 8.3018 ( 0 3 6) 0 0.3998 0.3295 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 767 1d7y_A) 0.3998 0.2666 8.2971 ( 0 1 6) 0 0.4000 0.2667 10 15 ( 6191 1v7o_A) ( 782 1dbh_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 792 1dce_B) nil ( 6191 1v7o_A) ( 795 1dcj_A) nil ( 6191 1v7o_A) ( 796 1dcp_A) 0.4000 0.6665 4.4055 ( 0 1 6) 0 0.5000 0.8329 10 6 ( 6191 1v7o_A) ( 801 1dcz_A) 0.3668 0.4657 10.6362 ( 1 5 6) 0 0.3668 0.4657 10 6 ( 6191 1v7o_A) ( 812 1de4_C) 0.3999 0.3333 7.7587 ( 0 4 6) 0 0.4204 0.3776 10 12 ( 6191 1v7o_A) ( 818 1df7_A) 0.4882 0.3813 8.4906 ( 1 9 10) 0 0.4882 0.3813 10 13 ( 6191 1v7o_A) ( 819 1df9_A) 0.3998 0.4441 8.2686 ( 0 5 6) 0 0.4000 0.4444 10 9 ( 6191 1v7o_A) ( 824 1dfc_A) 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