------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 2634 1iw0_A) ( 25 1a28_A) 0.1970 0.1895 13.2074 ( 2 4 6) 0 0.3997 0.2856 10 14 ( 2634 1iw0_A) ( 41 1a4i_A) 0.3988 0.5642 13.3989 ( 0 1 6) 0 0.3988 0.5642 10 7 ( 2634 1iw0_A) ( 51 1a6c_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 62 1a79_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 64 1a7s ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 77 1a8r_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 91 1aa6 ) 0.3999 0.1143 7.0496 ( 0 0 6) 0 0.4981 0.1671 10 35 ( 2634 1iw0_A) ( 96 1aba ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 129 1ahs_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 136 1aiu ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 147 1all_A) 0.1493 0.1497 12.0848 ( 2 3 6) 0 0.1493 0.1497 10 8 ( 2634 1iw0_A) ( 150 1aln ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 153 1aly ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 155 1am7_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 157 1amf ) 0.3984 0.1999 14.2559 ( 0 4 6) 0 0.3984 0.1999 10 20 ( 2634 1iw0_A) ( 161 1an8 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 162 1an8 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 169 1aoh_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 177 1aoz_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 191 1aqz_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 198 1at0 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 207 1aua ) 0.3353 0.2850 15.9136 ( 1 4 6) 0 0.3998 0.3076 10 13 ( 2634 1iw0_A) ( 233 1axi_B) nil ( 2634 1iw0_A) ( 259 1b0b ) 0.3362 0.3788 9.3375 ( 1 4 6) 0 0.3362 0.3788 10 7 ( 2634 1iw0_A) ( 293 1b5l ) 0.4998 0.8308 6.4191 ( 0 3 10) 0 0.4998 0.8308 10 6 ( 2634 1iw0_A) ( 300 1b6a ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 305 1b6r_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 307 1b74_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 315 1b8a_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 317 1b8d_A) 0.3997 0.4439 9.5067 ( 0 2 6) 0 0.4988 0.5536 10 9 ( 2634 1iw0_A) ( 329 1b9o_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 340 1bb9 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 350 1bd7_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 351 1bd8 ) 0.0999 0.0999 13.3644 ( 1 1 6) 0 0.0999 0.0999 10 9 ( 2634 1iw0_A) ( 360 1beb_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 361 1bed ) 0.3984 0.3327 14.3252 ( 0 2 6) 0 0.3984 0.3327 10 12 ( 2634 1iw0_A) ( 365 1bf2 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 367 1bf2 ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 372 1bfg ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 387 1bhg_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 405 1bih_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 417 1bkf ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 420 1bkz_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 433 1bo4_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 442 1bou_B) 0.3993 0.2000 11.6600 ( 0 5 6) 0 0.3993 0.2000 10 20 ( 2634 1iw0_A) ( 460 1btn ) nil ( 2634 1iw0_A) ( 472 1bup_A) 0.3990 0.3329 12.6071 ( 0 3 6) 0 0.3990 0.3329 10 12 ( 2634 1iw0_A) ( 491 1byf_A) nil ( 2634 1iw0_A) ( 495 1byr_A) 0.3994 0.3331 11.3315 ( 0 1 6) 0 0.3994 0.3331 10 12 ( 2634 1iw0_A) ( 541 1c8b_A) 0.3991 0.2222 12.3791 ( 0 2 6) 0 0.3991 0.2222 10 18 ( 2634 1iw0_A) ( 543 1c8n_A) 0.1493 0.1473 11.6954 ( 2 3 6) 0 0.1493 0.1473 10 14 ( 2634 1iw0_A) ( 553 1cb8_A) 0.4979 0.3331 11.5839 ( 0 3 10) 0 0.4993 0.3589 10 15 ( 2634 1iw0_A) 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